心率變異性測試儀的穩定度主要依賴心電信號采集質量、算法模型、抗干擾處理等三方面。像 科進心率變異分析儀 KHD6000 系列就是通過穩定采集 RR 間期并結合時間/頻率分析算法來輸出結果，因此基礎信號越穩定，HRV 越可靠。
影響穩定度最常見的因素是噪聲，例如體動、呼吸不穩定、肌電干擾、佩戴松動等。因此在實際使用時，經銷商需要提醒用戶坐姿穩定、呼吸自然、避免講話或移動，以保障心電波形清晰。心率變異性測試儀對 RR 間期的精度要求相當高，哪怕輕微誤差都可能影響后續分析結果，因此高質量前端采集格外關鍵。
算法也是一個決定因素。HRV 分析涉及時域參數、頻域參數、非線性參數等多種模型，不同廠家的處理邏輯、數據平滑方式、異常點剔除規則都可能造成差異。科進 KHD6000 系列的特點在于把復雜數據轉換成圖形化展示，如“壓力趨勢圖”“自主神經平衡圖”，更適合體檢或健康管理場景。
此外，使用環境也會影響結果。強電干擾、金屬桌面、手機靠近電極等都可能影響心電信號，因此建議在相對安靜、穩定的環境下測試。最后，HRV 本身具有一定波動性，即便同一人在不同時間測試也會出現差別，因此經銷商在介紹產品時需要強調：心率變異性測試儀更適合觀察趨勢，而不是檢測用途。
